维多利亚湖周围人口密度
维多利亚湖周边是世界上人口最为密集的区域之一，湖泊的周边遍布着城镇村落，对于这些数以百万计的人民来说，湖在生活中起着巨大的作用。
现在维多利亚湖的生态系统相当糟糕。自1950年代起，尼罗河鲈鱼被引入湖中，原意是想增加湖区渔业的产出。但是这种鲈鱼给当地的生态系统造成了灾难性的影响──数百种当地特产物种自此灭绝。更糟的是，本来不错的鲈鱼产量后来也急剧下降。不过正因为这些尼罗河鲈鱼被过渡捕捞，一些特产物种反倒开始回升。
另一个影响到本地生态的问题是原产于美洲热带的入侵物种水葫芦。这些水生植物是聚集而生，影响了交通，捕鱼，水力发电和生活饮水。1995年，90%的乌干达沿岸都被这种植物阻塞。由于机械和化学办法似乎都不起作用，人们只好培育一种以水葫芦为食的象鼻虫（Neochetina eichhorniae）并放到湖内，再加上1997年及1998年厄尔尼诺现象带来高水位，以及大风及强降雨破坏此植物，以及水质、优养化改善等因素，最终取得了良好的效果。若上述控制措施持续的话，水葫芦会继续的减少[9]。
维多利亚湖的污染情形也很严重，主要是来自流进湖内的未处理污水，其中包括工业及生活的废水，以及来自农场的肥料及化学物质。维多利亚湖盆地是世界上污染最严重的乡村地区，其沿岸有许多城市及乡村，其中的工厂直接排放废水到维多利亚湖，而其中的都市也排放未处理污水到进入维多利亚湖的河中，因此造成维多利亚湖的优氧化，更有助于水葫芦的入侵[10]。